檢疫旅館量能短缺，未來一般旅館也能收居家檢疫者，但有地方首長表示反對。中央流行疫情指揮中心今表示，檢疫重點是單獨住房、獨立衛浴，沒有傳染疑慮。台北市長柯文哲稍晚則強調，國旅一般旅客與居家檢疫者混在旅館一起住，「我的專業判斷這是防疫破口！」整段訪問中共講了這句話4次，「不是我們有意見每個都逆時中」，認為跟中央反映很久都不見其動作。

北市最近發現有多家旅館，並不是防疫旅館，卻也收居家檢疫者，事實上開放移工入境之後，防疫旅館不夠用，指揮中心統計雙北是和高雄市加起來防疫旅館的占床率超過八成嚴重不足，因此研議將開放一般旅館也能收防疫旅客，對此防疫旅館業者覺得有點不公平。