隨著國內確診數增加，居家隔離天數也進行調整，目前政策已放寬為3天1人1室，加上4天自主防疫，但機組員隔離天數卻依舊是5+5，讓機師工會不滿，認為指揮中心對機組員不聞不問，工會不滿，透露若政策沒調整，不排除直接到指揮中心前抗議。

紐西蘭籍機師造成台灣本土防疫漏洞，指揮中心和民航局、航空公司檢討後，決議未來機組員居家檢疫天數延長至7天加7天自主管理，且採檢陰性才可進入社區。台北市長柯文哲今、昨2日頻建議，應規劃空服員專屬園區，並比照一般人居檢14天。對此，指揮官陳時中回應，此舉恐讓機組員無透氣機會，進而造成飛安顧慮，「柯市長以前也講過，感染跟經濟間要取得平衡，我們現在正在努力這樣做」。