因應武漢肺炎升溫，總統蔡英文減少公開行程，不過該做的可一樣都沒少，包含視察口罩製作和酒精生產，12日中午也召集相關部會首長，召開國安會議，做出五點指示，包含確實執行600億紓困預算，並彙整各部門預算，投入紓困振興計畫，並擴大內需、打造好的民間投資環境，並緊盯國際金融市場，維持股匯市穩定。