小琉球海域生態豐富，現在還推出玻璃半潛艇，讓遊客不用下水，就能暢遊海底風光，但讓人遺憾的是，有專業潛水人員發現有隻海龜，牠的脖子遭箱網釣鉤勾住，幫牠解開時，卻已經沒有生命跡象，還有小丑魚的嘴也遭釣鈎勾住，保育人士希望能畫定區域海洋保護區，保住海底淨土，讓更多人能看到生態美景。