春節檢疫專案上路後，進入返鄉高峰，每天都有大量旅客進入防疫旅館，但大同區一家防疫旅館竟發生檢疫旅客大鬧事件，因為不滿飯店設施故障換房太慢，就違規衝出房門跑到大廳，嚇得業者緊急通報里幹事和員警到場才勸回房，沒想到隔天就獲報這名旅客確診，導致里幹事和4名員警都要居家隔離，還有員工因此離職。

從1月15日開始，所有入境台灣的旅客，除了附上三天內陰性證明報告外，還得附居家檢疫住所證明，因為新規定，居家檢疫者必須入住檢疫旅館或集中檢疫所，如果要在家中檢疫，得簽切結「一人一戶」，不能有同住家人，規定比之前更嚴格。

依據規定，回國需要居家檢疫的民眾，除了住在自己家，或親友無償提供的住所外，就必須入住防疫旅館，但台北市政府觀傳局發現，有些不肖業者，以付費短租方式，讓居家檢疫者住進他們的疑似日租套房，目前還有9人違規，目前也對3處違規的建物所有權人，開罰3000元。