國民黨中央支持核四公投，但宜蘭縣長林姿妙反對、新北市長侯友宜也不願正面相挺、台中市長盧秀燕也曾說，如果核四要在台中新建機組，她跟台中人都反對。黨主席朱立倫緊急切割，說重啟核四不是國民黨提案，但民進黨新北市議員陳啟能指出，核四公投領銜人黃士修曾擔任藍營智庫研究員，怎麼會跟國民黨沒關係。