總統府下午召開前總統李登輝的治喪大員會議，包括前副總統連戰等人都親自出席，歷經40分鐘討論做出相關決議，包含9月19日敲定真理大學禮拜堂辦追思禮拜會，10月7日在五指山國軍公墓特勳區進行奉安儀式，當天全國降半旗一天。