依據現行規定，公股民營事業獨立董事薪酬每月不得逾6萬元，不過華航替高層加薪，獨董薪水從5萬調到8萬，一般董事也多了2萬，調薪幅度高達67%。面對交通部勸阻，還拿高鐵當擋箭牌，說高鐵獨董月薪達15萬，導致高鐵也一起被交通部要求改正。對此，華航新任董座謝世謙回應，將在下次董事會中修正。