武漢肺炎疫情嚴峻，各界憂心大甲媽祖遶境恐成防疫缺口，但鎮瀾宮董事長顏清標今（26）日卻宣布活動照辦，但會精簡規模，除了取消起駕宴、媽祖之光晚會跟祝壽大典，今年也不讓信徒摸鑾轎、鑽轎底。顏清標強調，防疫專業在中央，只要政府喊停，他們絕對配合。不過大甲媽沿途經過的縣市鄉鎮卻如臨大敵，新港小鎮醫師陳錦煌憂心學生被感染，堅持學校一定不能外借，嘉義縣長翁章梁更請鎮瀾宮三思，緩辦或停辦。

因應武漢肺炎疫情，不少宗教團體都宣布，課程、營隊暫停。佛光山舉辦20年的禪淨共修，也首度改成線上直播。內政部長徐國勇更要求，所有宮廟得提出大型活動延期的備案，因為醫界提出呼籲，動輒千人群聚的宗教活動，恐怕會成為防疫漏洞。